MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 5788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017619	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017619	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017619	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017619	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017619	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017619	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017619	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017619	A	6	6	2708	2713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017619	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017619	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017619	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017619	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017619	A	8	8	4390	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017619	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017619	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017619	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017619	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017619	AAT	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017619	AGG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017619	AAC	2	6	13085	13090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017619	CTA	2	6	13646	13651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017619	T	6	6	15720	15725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017619	TTAT	2	8	15776	15783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017619	A	6	6	15868	15873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017619	CAA	2	6	15947	15952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017619	GAA	2	6	16535	16540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017619	A	6	6	16551	16556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017619	A	6	6	16585	16590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017619	A	6	6	16595	16600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017619	GAT	2	6	16623	16628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017619	A	6	6	16674	16679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017619	AGA	2	6	16708	16713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017619	A	7	7	16763	16769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017619	A	6	6	16775	16780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017619	AGA	2	6	16862	16867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017619	ACAAA	2	10	16914	16923	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017619	GGC	2	6	17007	17012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017619	GCA	2	6	17326	17331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017619	CGC	2	6	17373	17378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017619	GTGA	2	8	17379	17386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017619	TGT	2	6	17412	17417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017619	AGA	2	6	17421	17426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017619	AGA	2	6	17433	17438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017619	CAG	2	6	17495	17500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017619	AGCG	2	8	17550	17557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017619	AT	3	6	17679	17684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017619	GGA	2	6	17685	17690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017619	CT	3	6	17710	17715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017619	GAA	2	6	17949	17954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017619	GGT	2	6	18023	18028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017619	GTC	2	6	18037	18042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017619	TCGTG	2	10	18046	18055	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017619	CAT	2	6	18105	18110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017619	TAA	2	6	18140	18145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017619	GGA	2	6	18149	18154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017619	ATC	2	6	18173	18178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017619	AC	3	6	18200	18205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017619	CGC	2	6	18339	18344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017619	AC	3	6	18369	18374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017619	CAC	2	6	18384	18389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017619	AGCC	2	8	18432	18439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017619	GAT	2	6	18455	18460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017619	CCT	2	6	18511	18516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017619	TCT	2	6	18546	18551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017619	AGG	2	6	18612	18617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017619	AAC	2	6	18647	18652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017619	GTT	2	6	18657	18662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017619	A	6	6	18792	18797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017619	ATC	2	6	18850	18855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017619	AGT	2	6	18858	18863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017619	GTTAA	2	10	18925	18934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017619	ACG	2	6	18988	18993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017619	GTAA	2	8	19011	19018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017619	TCAC	2	8	19068	19075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017619	TAG	2	6	19159	19164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017619	GCGA	2	8	19167	19174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017619	AGG	2	6	19181	19186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017619	GAG	2	6	19194	19199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017619	CTC	2	6	19204	19209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017619	AGA	2	6	19246	19251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017619	AG	3	6	19274	19279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017619	T	6	6	19302	19307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017619	TCG	2	6	19349	19354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017619	GGA	2	6	19362	19367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017619	CT	3	6	19388	19393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017619	ACA	2	6	19480	19485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017619	ATG	2	6	19547	19552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017619	TAT	2	6	19612	19617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017619	GGA	2	6	19680	19685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017619	TC	3	6	19766	19771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017619	ACC	2	6	19946	19951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017619	AAT	2	6	19966	19971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017619	AGC	2	6	20026	20031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017619	ATTC	2	8	20033	20040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017619	TG	3	6	20157	20162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017619	AAG	2	6	20163	20168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017619	GAG	2	6	20178	20183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017619	GA	3	6	20308	20313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017619	ACA	2	6	20334	20339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017619	CTAA	2	8	20389	20396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017619	GA	3	6	20604	20609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017619	CT	3	6	20720	20725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017619	GAT	2	6	20738	20743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017619	AGG	2	6	20783	20788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017619	CGG	2	6	20829	20834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017619	GA	3	6	20927	20932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017619	TAGG	2	8	21045	21052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017619	TAC	2	6	21099	21104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017619	CCT	2	6	21187	21192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017619	GGT	2	6	21323	21328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017619	TCG	2	6	21438	21443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017619	CGT	2	6	21518	21523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017619	GA	3	6	21742	21747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017619	TGGAAG	2	12	21765	21776	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017619	AGT	2	6	21909	21914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017619	CAG	2	6	21960	21965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017619	AGT	2	6	21986	21991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017619	AATC	2	8	22191	22198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017619	ACC	2	6	22509	22514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017619	CGT	2	6	22546	22551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017619	ATTAT	2	10	22860	22869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017619	CGC	2	6	22939	22944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017619	TA	3	6	22945	22950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017619	AT	3	6	23036	23041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017619	GGA	2	6	23043	23048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017619	GCGT	2	8	23102	23109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017619	TCC	2	6	23126	23131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017619	CTA	2	6	23136	23141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017619	AGC	2	6	23153	23158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017619	TCG	2	6	23167	23172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017619	CGG	2	6	23279	23284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017619	TAT	2	6	23327	23332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017619	GGT	2	6	23385	23390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017619	ATATT	2	10	23409	23418	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017619	AT	3	6	23562	23567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017619	TAA	2	6	24916	24921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017619	T	7	7	24943	24949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017619	GA	3	6	24958	24963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017619	GAG	2	6	24977	24982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017619	TTTG	2	8	26290	26297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017619	AT	3	6	26337	26342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017619	AGG	2	6	26343	26348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017619	CTT	2	6	27345	27350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017619	T	6	6	27349	27354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017619	ATTT	2	8	27357	27364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017619	TAT	2	6	27373	27378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017619	T	6	6	30622	30627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017619	T	6	6	39830	39835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017619	T	6	6	42780	42785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017619	TTA	2	6	42788	42793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017619	AATA	2	8	46215	46222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_017619	T	7	7	110507	110513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_017619	TCA	2	6	110571	110576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_017619	TA	3	6	110585	110590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_017619	CTT	2	6	110660	110665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_017619	TG	3	6	110800	110805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
437	NC_017619	CGT	2	6	110847	110852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_017619	TTA	2	6	110979	110984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_017619	TCC	2	6	119101	119106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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471	NC_017619	ATT	2	6	119911	119916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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